La versión japonesa, Final Mission, se lanzó un año antes que la versión estadounidense y hay algunas diferencias entre las dos. La secuencia de la historia de apertura del juego es completamente diferente, mostrando la destrucción de varias ciudades antes de que comience la invasión alienígena. En lugar de un personaje principal masculino o femenino seleccionable, ambos jugadores controlan soldados masculinos de paleta intercambiada, uno de los cuales es ruso,