A lo largo de la franquicia Fate, parejas de amos y espíritus heroicos, también conocidos como sirvientes, han estado luchando a lo largo de la historia en una serie de Guerras del Santo Grial, y el dúo ganador recibe un antiguo artefacto que concede deseos. Fate/Samurai Remnant continúa la épica Guerra del Santo Grial de la serie en el cuarto año de la Era Keian, el Período Edo de Japón. Han pasado varias décadas desde el final de una era turbulenta y empapada de sangre, y mientras la gente finalmente disfruta de paz y tranquilidad, se libra una batalla.