El caso del centenario: una historia de Shijima se centra en la desafortunada familia Shijima, que ha experimentado una cadena de muertes inexplicables en su familia durante el último siglo. Los jugadores asumirán el papel de la novelista de misterio Haruka Kagami y usarán sus poderes de deducción para descubrir la verdad detrás de cuatro casos de asesinato que han tenido lugar en la casa Shijima durante los últimos cien años.